L’organizzazione del PTHM richiama il sistema gerarchico dei Templari. Tuttavia si tratta di una gerarchia funzionale finalizzata al buon funzionamento della organizzazione.
Al vertice si trova il PRIORE coadiuvato dal Gran Consiglio.
I Gran Ufficiali svolgono specifici ruoli nella organizzazione quali il Gran Cancelliere, il Gran Tesoriere, il Gran Maniscalco, il Gran Referendario, il Gran Araldo, ect.
Le due macro aree, Italia Centro-Settentrionale e Centro-Meridionale sono coordinate dai due Gran Balivi.
Ogni regione invece ha un Balivo che coordina le Commende e Precettorie.
Selezionando dal menu :
è possibile visualizzare l’intera struttura suddivisa per gruppi omogenei.